Cadascun dels antígens del virus causant de la mononucleosi infecciosa codificat en les cèl·lules infectades. En les primeres fases de les infeccions lítiques s'expressen, al menys, sis antígens nuclears del virus d'Epstein-Barr, antígens que també poden ser expressats per algunes cèl·lules amb infecció latent. D'altres dues proteïnes, anomenades proteïnes latents de membrana, s'expressen en la superfície de les cèl·lules amb infecció latent. D'altres antígens proteics estructurals del virus, per exemple els antígens de la càpsida vírica, s'expressen en l'interior de les cèl·lules infectades i en les partícules víriques alliberades durant les infeccions lítiques.